La Unidad Financiera Institucional (UFI) es la responsables de la dirección, coordinación y supervisión de la gestión financiera del Centro Nacional de Registros (CNR), así como de brindar apoyo técnico para la ejecución de las operaciones financieras y de proyectos institucionales, realizando las actividades del proceso Administrativo Financiero de Presupuesto, Tesorería y Contabilidad, en forma integrada e interrelacionada, utilizando para ello el Sistema de Administración Financiera Integrado – SAFI.

La UFI sirve de enlace externo con las Direcciones Generales de los Subsistemas del SAFI del Ministerio de Hacienda, y al interior de la institución con las Direcciones, Gerencias y Unidades Administrativas, en cuanto a la coordinación de las actividades técnicas financieras, registros de ingresos y egresos presupuestarios y demás actividades que se deriven de la gestión financiera institucional.